Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIA2P42262 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms