Protein–RNA interactions for Protein: P23193

TCEA1, Transcription elongation factor A protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1P23193 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TCEA1P23193 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCEA1P23193 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms