Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRATO95237 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRATO95237 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRATO95237 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LRATO95237 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRATO95237 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRATO95237 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRATO95237 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRATO95237 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRATO95237 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRATO95237 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRATO95237 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRATO95237 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRATO95237 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LRATO95237 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRATO95237 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRATO95237 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRATO95237 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LRATO95237 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRATO95237 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRATO95237 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRATO95237 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LRATO95237 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRATO95237 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LRATO95237 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LRATO95237 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRATO95237 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LRATO95237 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LRATO95237 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LRATO95237 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LRATO95237 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRATO95237 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LRATO95237 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LRATO95237 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LRATO95237 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRATO95237 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LRATO95237 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LRATO95237 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LRATO95237 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LRATO95237 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LRATO95237 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LRATO95237 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LRATO95237 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRATO95237 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LRATO95237 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LRATO95237 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRATO95237 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LRATO95237 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRATO95237 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRATO95237 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LRATO95237 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRATO95237 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRATO95237 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LRATO95237 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRATO95237 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRATO95237 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRATO95237 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRATO95237 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRATO95237 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRATO95237 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRATO95237 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRATO95237 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRATO95237 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRATO95237 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRATO95237 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRATO95237 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRATO95237 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRATO95237 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LRATO95237 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LRATO95237 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRATO95237 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRATO95237 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRATO95237 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRATO95237 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRATO95237 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRATO95237 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRATO95237 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRATO95237 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRATO95237 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRATO95237 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRATO95237 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRATO95237 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRATO95237 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRATO95237 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRATO95237 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LRATO95237 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRATO95237 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRATO95237 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRATO95237 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRATO95237 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRATO95237 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRATO95237 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRATO95237 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRATO95237 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRATO95237 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRATO95237 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRATO95237 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRATO95237 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRATO95237 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRATO95237 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms