Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPLO60437 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPLO60437 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPLO60437 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPLO60437 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPLO60437 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPLO60437 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPLO60437 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPLO60437 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPLO60437 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPLO60437 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPLO60437 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPLO60437 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPLO60437 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPLO60437 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPLO60437 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPLO60437 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPLO60437 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPLO60437 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPLO60437 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPLO60437 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPLO60437 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPLO60437 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPLO60437 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPLO60437 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPLO60437 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPLO60437 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PPLO60437 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PPLO60437 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PPLO60437 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PPLO60437 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PPLO60437 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PPLO60437 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PPLO60437 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PPLO60437 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
PPLO60437 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PPLO60437 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PPLO60437 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
PPLO60437 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
PPLO60437 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPLO60437 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPLO60437 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPLO60437 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPLO60437 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPLO60437 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPLO60437 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPLO60437 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPLO60437 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPLO60437 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPLO60437 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPLO60437 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PPLO60437 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPLO60437 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PPLO60437 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPLO60437 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPLO60437 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PPLO60437 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPLO60437 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPLO60437 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PPLO60437 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPLO60437 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PPLO60437 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPLO60437 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPLO60437 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPLO60437 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPLO60437 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPLO60437 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPLO60437 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPLO60437 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPLO60437 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPLO60437 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPLO60437 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPLO60437 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPLO60437 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPLO60437 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPLO60437 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPLO60437 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPLO60437 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPLO60437 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PPLO60437 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPLO60437 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPLO60437 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPLO60437 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPLO60437 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPLO60437 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPLO60437 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPLO60437 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPLO60437 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPLO60437 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPLO60437 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPLO60437 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPLO60437 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPLO60437 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPLO60437 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPLO60437 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPLO60437 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPLO60437 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPLO60437 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPLO60437 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPLO60437 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms