Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBDO15205 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBDO15205 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBDO15205 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
UBDO15205 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBDO15205 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBDO15205 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBDO15205 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
UBDO15205 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBDO15205 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBDO15205 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBDO15205 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBDO15205 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBDO15205 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBDO15205 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBDO15205 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBDO15205 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBDO15205 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBDO15205 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBDO15205 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBDO15205 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBDO15205 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBDO15205 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBDO15205 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBDO15205 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBDO15205 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBDO15205 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBDO15205 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
UBDO15205 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBDO15205 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBDO15205 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
UBDO15205 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBDO15205 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBDO15205 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBDO15205 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBDO15205 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
UBDO15205 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBDO15205 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBDO15205 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBDO15205 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBDO15205 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBDO15205 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBDO15205 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBDO15205 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBDO15205 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBDO15205 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBDO15205 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBDO15205 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBDO15205 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBDO15205 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBDO15205 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBDO15205 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBDO15205 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBDO15205 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBDO15205 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBDO15205 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBDO15205 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBDO15205 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBDO15205 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBDO15205 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBDO15205 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBDO15205 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBDO15205 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBDO15205 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
UBDO15205 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBDO15205 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBDO15205 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBDO15205 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBDO15205 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBDO15205 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBDO15205 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
UBDO15205 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBDO15205 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBDO15205 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBDO15205 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBDO15205 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBDO15205 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBDO15205 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBDO15205 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBDO15205 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBDO15205 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBDO15205 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBDO15205 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBDO15205 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBDO15205 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBDO15205 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBDO15205 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBDO15205 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBDO15205 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBDO15205 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBDO15205 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBDO15205 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBDO15205 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBDO15205 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBDO15205 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBDO15205 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBDO15205 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBDO15205 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBDO15205 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBDO15205 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms