Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC78A2IDD5 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms