Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM2AQ9Y2K7 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM2AQ9Y2K7 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM2AQ9Y2K7 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM2AQ9Y2K7 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM2AQ9Y2K7 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM2AQ9Y2K7 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM2AQ9Y2K7 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM2AQ9Y2K7 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms