Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
DUOX2Q9NRD8 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms