Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMG20AQ9NP66 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms