Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
KDM5DQ9BY66 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
KDM5DQ9BY66 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
KDM5DQ9BY66 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KDM5DQ9BY66 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KDM5DQ9BY66 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KDM5DQ9BY66 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KDM5DQ9BY66 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KDM5DQ9BY66 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
KDM5DQ9BY66 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KDM5DQ9BY66 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KDM5DQ9BY66 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KDM5DQ9BY66 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KDM5DQ9BY66 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KDM5DQ9BY66 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
KDM5DQ9BY66 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KDM5DQ9BY66 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KDM5DQ9BY66 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KDM5DQ9BY66 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KDM5DQ9BY66 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM5DQ9BY66 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms