Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms