Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV29

CCDC32, Coiled-coil domain-containing protein 32, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC32Q9BV29 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC32Q9BV29 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms