Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms