Protein–RNA interactions for Protein: Q96PW8

CSPG4P5, Putative uncharacterized protein KIAA1920, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG4P5Q96PW8 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSPG4P5Q96PW8 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms