Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms