Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms