Protein–RNA interactions for Protein: Q76I76

SSH2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH2Q76I76 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSH2Q76I76 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SSH2Q76I76 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSH2Q76I76 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSH2Q76I76 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSH2Q76I76 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSH2Q76I76 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSH2Q76I76 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSH2Q76I76 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SSH2Q76I76 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSH2Q76I76 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSH2Q76I76 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSH2Q76I76 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSH2Q76I76 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSH2Q76I76 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSH2Q76I76 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSH2Q76I76 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSH2Q76I76 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSH2Q76I76 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSH2Q76I76 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSH2Q76I76 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSH2Q76I76 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSH2Q76I76 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSH2Q76I76 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSH2Q76I76 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSH2Q76I76 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSH2Q76I76 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSH2Q76I76 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSH2Q76I76 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SSH2Q76I76 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSH2Q76I76 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSH2Q76I76 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSH2Q76I76 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSH2Q76I76 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSH2Q76I76 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSH2Q76I76 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SSH2Q76I76 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
SSH2Q76I76 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSH2Q76I76 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SSH2Q76I76 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSH2Q76I76 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSH2Q76I76 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSH2Q76I76 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSH2Q76I76 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSH2Q76I76 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSH2Q76I76 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSH2Q76I76 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSH2Q76I76 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSH2Q76I76 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSH2Q76I76 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSH2Q76I76 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSH2Q76I76 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSH2Q76I76 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSH2Q76I76 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSH2Q76I76 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SSH2Q76I76 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SSH2Q76I76 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSH2Q76I76 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSH2Q76I76 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SSH2Q76I76 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSH2Q76I76 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSH2Q76I76 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSH2Q76I76 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSH2Q76I76 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSH2Q76I76 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSH2Q76I76 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSH2Q76I76 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSH2Q76I76 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSH2Q76I76 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSH2Q76I76 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSH2Q76I76 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSH2Q76I76 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSH2Q76I76 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSH2Q76I76 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSH2Q76I76 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SSH2Q76I76 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SSH2Q76I76 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSH2Q76I76 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSH2Q76I76 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSH2Q76I76 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSH2Q76I76 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSH2Q76I76 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SSH2Q76I76 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSH2Q76I76 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSH2Q76I76 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSH2Q76I76 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSH2Q76I76 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSH2Q76I76 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSH2Q76I76 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSH2Q76I76 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SSH2Q76I76 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSH2Q76I76 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSH2Q76I76 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSH2Q76I76 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSH2Q76I76 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSH2Q76I76 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSH2Q76I76 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSH2Q76I76 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSH2Q76I76 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSH2Q76I76 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms