Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TMUB2Q71RG4 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMUB2Q71RG4 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMUB2Q71RG4 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TMUB2Q71RG4 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMUB2Q71RG4 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMUB2Q71RG4 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMUB2Q71RG4 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMUB2Q71RG4 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMUB2Q71RG4 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMUB2Q71RG4 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMUB2Q71RG4 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMUB2Q71RG4 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMUB2Q71RG4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMUB2Q71RG4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMUB2Q71RG4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMUB2Q71RG4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TMUB2Q71RG4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMUB2Q71RG4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMUB2Q71RG4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMUB2Q71RG4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMUB2Q71RG4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMUB2Q71RG4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMUB2Q71RG4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TMUB2Q71RG4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TMUB2Q71RG4 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TMUB2Q71RG4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMUB2Q71RG4 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMUB2Q71RG4 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMUB2Q71RG4 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMUB2Q71RG4 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMUB2Q71RG4 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMUB2Q71RG4 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMUB2Q71RG4 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMUB2Q71RG4 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMUB2Q71RG4 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMUB2Q71RG4 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TMUB2Q71RG4 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMUB2Q71RG4 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMUB2Q71RG4 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMUB2Q71RG4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMUB2Q71RG4 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMUB2Q71RG4 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMUB2Q71RG4 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMUB2Q71RG4 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMUB2Q71RG4 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMUB2Q71RG4 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMUB2Q71RG4 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMUB2Q71RG4 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMUB2Q71RG4 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMUB2Q71RG4 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMUB2Q71RG4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMUB2Q71RG4 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMUB2Q71RG4 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMUB2Q71RG4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMUB2Q71RG4 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMUB2Q71RG4 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMUB2Q71RG4 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMUB2Q71RG4 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMUB2Q71RG4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMUB2Q71RG4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMUB2Q71RG4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMUB2Q71RG4 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMUB2Q71RG4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMUB2Q71RG4 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMUB2Q71RG4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMUB2Q71RG4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TMUB2Q71RG4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMUB2Q71RG4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMUB2Q71RG4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMUB2Q71RG4 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMUB2Q71RG4 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMUB2Q71RG4 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMUB2Q71RG4 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TMUB2Q71RG4 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms