Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC149Q6ZUS6 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC149Q6ZUS6 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC149Q6ZUS6 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC149Q6ZUS6 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC149Q6ZUS6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC149Q6ZUS6 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC149Q6ZUS6 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC149Q6ZUS6 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC149Q6ZUS6 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC149Q6ZUS6 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC149Q6ZUS6 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC149Q6ZUS6 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC149Q6ZUS6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC149Q6ZUS6 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC149Q6ZUS6 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC149Q6ZUS6 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC149Q6ZUS6 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC149Q6ZUS6 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC149Q6ZUS6 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC149Q6ZUS6 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC149Q6ZUS6 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC149Q6ZUS6 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC149Q6ZUS6 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC149Q6ZUS6 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC149Q6ZUS6 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC149Q6ZUS6 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC149Q6ZUS6 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC149Q6ZUS6 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC149Q6ZUS6 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC149Q6ZUS6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC149Q6ZUS6 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC149Q6ZUS6 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC149Q6ZUS6 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC149Q6ZUS6 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC149Q6ZUS6 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC149Q6ZUS6 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC149Q6ZUS6 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC149Q6ZUS6 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC149Q6ZUS6 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC149Q6ZUS6 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC149Q6ZUS6 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC149Q6ZUS6 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC149Q6ZUS6 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC149Q6ZUS6 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC149Q6ZUS6 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC149Q6ZUS6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC149Q6ZUS6 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC149Q6ZUS6 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC149Q6ZUS6 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC149Q6ZUS6 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC149Q6ZUS6 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC149Q6ZUS6 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC149Q6ZUS6 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC149Q6ZUS6 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC149Q6ZUS6 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC149Q6ZUS6 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC149Q6ZUS6 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC149Q6ZUS6 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC149Q6ZUS6 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC149Q6ZUS6 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC149Q6ZUS6 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC149Q6ZUS6 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC149Q6ZUS6 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC149Q6ZUS6 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC149Q6ZUS6 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC149Q6ZUS6 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC149Q6ZUS6 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC149Q6ZUS6 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC149Q6ZUS6 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC149Q6ZUS6 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC149Q6ZUS6 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC149Q6ZUS6 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC149Q6ZUS6 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC149Q6ZUS6 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC149Q6ZUS6 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC149Q6ZUS6 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC149Q6ZUS6 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC149Q6ZUS6 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC149Q6ZUS6 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC149Q6ZUS6 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC149Q6ZUS6 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC149Q6ZUS6 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC149Q6ZUS6 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC149Q6ZUS6 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC149Q6ZUS6 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC149Q6ZUS6 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC149Q6ZUS6 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC149Q6ZUS6 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC149Q6ZUS6 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC149Q6ZUS6 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC149Q6ZUS6 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC149Q6ZUS6 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC149Q6ZUS6 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC149Q6ZUS6 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC149Q6ZUS6 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC149Q6ZUS6 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC149Q6ZUS6 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC149Q6ZUS6 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC149Q6ZUS6 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms