Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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CTF1Q16619 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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CTF1Q16619 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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CTF1Q16619 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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CTF1Q16619 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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CTF1Q16619 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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CTF1Q16619 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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CTF1Q16619 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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CTF1Q16619 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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