Protein–RNA interactions for Protein: Q15388

TOMM20, Mitochondrial import receptor subunit TOM20 homolog, humanhuman

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM20Q15388 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TOMM20Q15388 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TOMM20Q15388 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TOMM20Q15388 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TOMM20Q15388 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TOMM20Q15388 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TOMM20Q15388 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TOMM20Q15388 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TOMM20Q15388 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TOMM20Q15388 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TOMM20Q15388 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TOMM20Q15388 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TOMM20Q15388 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TOMM20Q15388 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TOMM20Q15388 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TOMM20Q15388 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TOMM20Q15388 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TOMM20Q15388 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TOMM20Q15388 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TOMM20Q15388 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TOMM20Q15388 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TOMM20Q15388 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TOMM20Q15388 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TOMM20Q15388 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TOMM20Q15388 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TOMM20Q15388 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TOMM20Q15388 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms