Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CKAP5Q14008 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms