Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
TFCP2Q12800 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TFCP2Q12800 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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