Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms