Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms