Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms