Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC1A1P43005 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC1A1P43005 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC1A1P43005 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC1A1P43005 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC1A1P43005 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC1A1P43005 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC1A1P43005 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC1A1P43005 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC1A1P43005 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC1A1P43005 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC1A1P43005 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC1A1P43005 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC1A1P43005 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC1A1P43005 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC1A1P43005 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC1A1P43005 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC1A1P43005 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC1A1P43005 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC1A1P43005 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC1A1P43005 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC1A1P43005 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC1A1P43005 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC1A1P43005 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC1A1P43005 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC1A1P43005 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC1A1P43005 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC1A1P43005 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC1A1P43005 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC1A1P43005 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC1A1P43005 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC1A1P43005 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC1A1P43005 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC1A1P43005 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC1A1P43005 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC1A1P43005 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC1A1P43005 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC1A1P43005 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC1A1P43005 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC1A1P43005 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC1A1P43005 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC1A1P43005 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC1A1P43005 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC1A1P43005 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC1A1P43005 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC1A1P43005 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC1A1P43005 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC1A1P43005 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC1A1P43005 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC1A1P43005 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC1A1P43005 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC1A1P43005 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC1A1P43005 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC1A1P43005 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC1A1P43005 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC1A1P43005 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC1A1P43005 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC1A1P43005 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC1A1P43005 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC1A1P43005 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC1A1P43005 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC1A1P43005 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC1A1P43005 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC1A1P43005 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC1A1P43005 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC1A1P43005 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC1A1P43005 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC1A1P43005 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC1A1P43005 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms