Protein–RNA interactions for Protein: P36405

ARL3, ADP-ribosylation factor-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL3P36405 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ARL3P36405 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ARL3P36405 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ARL3P36405 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ARL3P36405 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ARL3P36405 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ARL3P36405 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
ARL3P36405 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ARL3P36405 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ARL3P36405 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
ARL3P36405 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ARL3P36405 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL3P36405 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL3P36405 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL3P36405 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL3P36405 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL3P36405 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL3P36405 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL3P36405 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL3P36405 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL3P36405 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL3P36405 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL3P36405 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL3P36405 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL3P36405 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL3P36405 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL3P36405 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL3P36405 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL3P36405 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL3P36405 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL3P36405 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL3P36405 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL3P36405 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL3P36405 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL3P36405 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL3P36405 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL3P36405 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL3P36405 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL3P36405 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL3P36405 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL3P36405 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL3P36405 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL3P36405 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL3P36405 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL3P36405 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL3P36405 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL3P36405 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL3P36405 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL3P36405 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL3P36405 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL3P36405 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL3P36405 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL3P36405 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL3P36405 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL3P36405 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL3P36405 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL3P36405 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL3P36405 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL3P36405 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL3P36405 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL3P36405 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL3P36405 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL3P36405 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL3P36405 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL3P36405 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL3P36405 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL3P36405 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL3P36405 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL3P36405 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL3P36405 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL3P36405 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL3P36405 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL3P36405 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL3P36405 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL3P36405 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL3P36405 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL3P36405 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL3P36405 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL3P36405 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL3P36405 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL3P36405 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL3P36405 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL3P36405 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL3P36405 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL3P36405 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL3P36405 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL3P36405 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL3P36405 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL3P36405 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL3P36405 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL3P36405 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL3P36405 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL3P36405 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL3P36405 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL3P36405 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL3P36405 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL3P36405 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL3P36405 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL3P36405 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ARL3P36405 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms