Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PEX2P28328 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PEX2P28328 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PEX2P28328 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PEX2P28328 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PEX2P28328 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PEX2P28328 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PEX2P28328 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PEX2P28328 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PEX2P28328 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PEX2P28328 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PEX2P28328 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PEX2P28328 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PEX2P28328 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PEX2P28328 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PEX2P28328 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PEX2P28328 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PEX2P28328 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PEX2P28328 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PEX2P28328 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PEX2P28328 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PEX2P28328 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PEX2P28328 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PEX2P28328 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PEX2P28328 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PEX2P28328 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PEX2P28328 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PEX2P28328 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PEX2P28328 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PEX2P28328 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PEX2P28328 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PEX2P28328 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PEX2P28328 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PEX2P28328 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PEX2P28328 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PEX2P28328 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PEX2P28328 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PEX2P28328 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PEX2P28328 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PEX2P28328 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PEX2P28328 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PEX2P28328 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PEX2P28328 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PEX2P28328 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PEX2P28328 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PEX2P28328 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PEX2P28328 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PEX2P28328 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PEX2P28328 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PEX2P28328 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PEX2P28328 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PEX2P28328 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PEX2P28328 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PEX2P28328 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PEX2P28328 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PEX2P28328 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PEX2P28328 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PEX2P28328 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PEX2P28328 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PEX2P28328 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PEX2P28328 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PEX2P28328 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PEX2P28328 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PEX2P28328 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PEX2P28328 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PEX2P28328 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PEX2P28328 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PEX2P28328 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PEX2P28328 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PEX2P28328 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PEX2P28328 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PEX2P28328 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PEX2P28328 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PEX2P28328 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PEX2P28328 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PEX2P28328 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PEX2P28328 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PEX2P28328 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PEX2P28328 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PEX2P28328 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PEX2P28328 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PEX2P28328 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PEX2P28328 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PEX2P28328 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PEX2P28328 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PEX2P28328 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PEX2P28328 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PEX2P28328 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PEX2P28328 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PEX2P28328 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PEX2P28328 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PEX2P28328 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PEX2P28328 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PEX2P28328 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PEX2P28328 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PEX2P28328 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PEX2P28328 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PEX2P28328 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PEX2P28328 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PEX2P28328 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms