Protein–RNA interactions for Protein: O95045

UPP2, Uridine phosphorylase 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP2O95045 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UPP2O95045 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UPP2O95045 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UPP2O95045 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UPP2O95045 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UPP2O95045 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UPP2O95045 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UPP2O95045 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UPP2O95045 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UPP2O95045 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UPP2O95045 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
UPP2O95045 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UPP2O95045 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UPP2O95045 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UPP2O95045 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UPP2O95045 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UPP2O95045 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UPP2O95045 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UPP2O95045 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
UPP2O95045 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UPP2O95045 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UPP2O95045 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UPP2O95045 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UPP2O95045 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UPP2O95045 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UPP2O95045 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UPP2O95045 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UPP2O95045 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UPP2O95045 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UPP2O95045 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UPP2O95045 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UPP2O95045 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UPP2O95045 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UPP2O95045 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UPP2O95045 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UPP2O95045 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UPP2O95045 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UPP2O95045 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UPP2O95045 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
UPP2O95045 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UPP2O95045 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UPP2O95045 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UPP2O95045 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UPP2O95045 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UPP2O95045 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UPP2O95045 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UPP2O95045 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UPP2O95045 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UPP2O95045 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UPP2O95045 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UPP2O95045 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UPP2O95045 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UPP2O95045 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UPP2O95045 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
UPP2O95045 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UPP2O95045 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UPP2O95045 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UPP2O95045 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
UPP2O95045 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UPP2O95045 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UPP2O95045 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UPP2O95045 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UPP2O95045 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UPP2O95045 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UPP2O95045 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UPP2O95045 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UPP2O95045 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UPP2O95045 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UPP2O95045 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UPP2O95045 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UPP2O95045 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UPP2O95045 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UPP2O95045 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
UPP2O95045 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UPP2O95045 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UPP2O95045 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UPP2O95045 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UPP2O95045 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UPP2O95045 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
UPP2O95045 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UPP2O95045 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UPP2O95045 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UPP2O95045 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UPP2O95045 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UPP2O95045 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
UPP2O95045 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
UPP2O95045 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
UPP2O95045 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
UPP2O95045 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UPP2O95045 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UPP2O95045 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UPP2O95045 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UPP2O95045 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UPP2O95045 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UPP2O95045 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UPP2O95045 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UPP2O95045 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UPP2O95045 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
UPP2O95045 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UPP2O95045 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms