Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNQ3O43525 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KCNQ3O43525 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms