Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VGFO15240 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VGFO15240 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VGFO15240 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VGFO15240 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VGFO15240 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VGFO15240 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VGFO15240 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VGFO15240 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
VGFO15240 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VGFO15240 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VGFO15240 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VGFO15240 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VGFO15240 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
VGFO15240 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VGFO15240 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VGFO15240 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VGFO15240 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VGFO15240 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VGFO15240 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
VGFO15240 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VGFO15240 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VGFO15240 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VGFO15240 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VGFO15240 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VGFO15240 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
VGFO15240 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VGFO15240 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VGFO15240 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VGFO15240 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VGFO15240 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VGFO15240 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VGFO15240 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VGFO15240 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VGFO15240 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VGFO15240 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VGFO15240 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VGFO15240 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VGFO15240 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VGFO15240 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VGFO15240 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VGFO15240 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VGFO15240 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VGFO15240 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VGFO15240 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
VGFO15240 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VGFO15240 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VGFO15240 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VGFO15240 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VGFO15240 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VGFO15240 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VGFO15240 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VGFO15240 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VGFO15240 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VGFO15240 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VGFO15240 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VGFO15240 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VGFO15240 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VGFO15240 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VGFO15240 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VGFO15240 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
VGFO15240 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
VGFO15240 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
VGFO15240 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VGFO15240 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
VGFO15240 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VGFO15240 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VGFO15240 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VGFO15240 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VGFO15240 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VGFO15240 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VGFO15240 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VGFO15240 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
VGFO15240 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
VGFO15240 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
VGFO15240 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VGFO15240 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VGFO15240 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VGFO15240 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VGFO15240 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VGFO15240 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VGFO15240 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VGFO15240 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VGFO15240 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VGFO15240 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VGFO15240 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VGFO15240 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VGFO15240 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VGFO15240 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VGFO15240 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VGFO15240 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VGFO15240 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VGFO15240 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VGFO15240 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VGFO15240 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VGFO15240 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VGFO15240 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VGFO15240 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VGFO15240 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VGFO15240 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
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