Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms