Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I6

NINL, Ninein-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINLQ9Y2I6 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms