Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms