Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN8

GTF3C4, General transcription factor 3C polypeptide 4, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4Q9UKN8 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF3C4Q9UKN8 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF3C4Q9UKN8 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF3C4Q9UKN8 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF3C4Q9UKN8 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF3C4Q9UKN8 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms