Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms