Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
NKX1-2Q9UD57 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NKX1-2Q9UD57 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms