Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM53CQ9NYF3 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM53CQ9NYF3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM53CQ9NYF3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM53CQ9NYF3 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM53CQ9NYF3 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM53CQ9NYF3 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM53CQ9NYF3 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM53CQ9NYF3 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM53CQ9NYF3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM53CQ9NYF3 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM53CQ9NYF3 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM53CQ9NYF3 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM53CQ9NYF3 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM53CQ9NYF3 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM53CQ9NYF3 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM53CQ9NYF3 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM53CQ9NYF3 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM53CQ9NYF3 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM53CQ9NYF3 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM53CQ9NYF3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM53CQ9NYF3 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM53CQ9NYF3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM53CQ9NYF3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM53CQ9NYF3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM53CQ9NYF3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM53CQ9NYF3 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM53CQ9NYF3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM53CQ9NYF3 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms