Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms