Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FZD3Q9NPG1 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms