Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLIRPQ9GZT3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms