Protein–RNA interactions for Protein: Q96BT3

CENPT, Centromere protein T, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPTQ96BT3 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms