Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUR7

C15orf40, UPF0235 protein C15orf40, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40Q8WUR7 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C15orf40Q8WUR7 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms