Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM4

PRAMEF8, PRAME family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF8Q5VWM4 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms