Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
COL5A1-AS1Q5SY13 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
COL5A1-AS1Q5SY13 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
COL5A1-AS1Q5SY13 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
COL5A1-AS1Q5SY13 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
COL5A1-AS1Q5SY13 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
COL5A1-AS1Q5SY13 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
COL5A1-AS1Q5SY13 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
COL5A1-AS1Q5SY13 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
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COL5A1-AS1Q5SY13 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
COL5A1-AS1Q5SY13 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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COL5A1-AS1Q5SY13 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
COL5A1-AS1Q5SY13 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
COL5A1-AS1Q5SY13 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
COL5A1-AS1Q5SY13 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
COL5A1-AS1Q5SY13 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
COL5A1-AS1Q5SY13 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
COL5A1-AS1Q5SY13 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
COL5A1-AS1Q5SY13 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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COL5A1-AS1Q5SY13 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
COL5A1-AS1Q5SY13 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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COL5A1-AS1Q5SY13 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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COL5A1-AS1Q5SY13 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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