Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF239Q16600 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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