Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
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NCOA1Q15788 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
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NCOA1Q15788 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
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NCOA1Q15788 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
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NCOA1Q15788 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
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NCOA1Q15788 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCOA1Q15788 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
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