Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP13Q15645 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms