Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms